DNAman:让分子生物学研究变得简单易行的软件 (dnaman是干嘛的)

DNAman是一个强大的分子生物学软件,可帮助研究人员分析和操作DNA和蛋白质序列,DNAman的主要功能包括,序列编辑和装配,DNAman允许研究人员轻松地编辑、装配和操纵DNA和蛋白质序列,序列分析,DNAman提供了一系列序列分析工具,包括密码子表、开放阅读框查找器和限制性内切酶映射器,引物设计,DNAman可帮助研究人员设计用…。

DNAman是一个强大的分子生物学软件,可帮助研究人员分析和操作DNA和蛋白质序列。

DNAman的主要功能包括:

  • 序列编辑和装配:DNAman允许研究人员轻松地编辑、装配和操纵DNA和蛋白质序列。
  • 序列分析:DNAman提供了一系列序列分析工具,包括密码子表、开放阅读框查找器和限制性内切酶映射器。
  • 引物设计:DNAman可帮助研究人员设计用于PCR、测序和qPCR

以下哪些是科研常用软件

最全生物、化学、先进制造、科研软件大合集

生物化学制图、分析类软件及小众通用办公软件,

良心推荐!!!

有免费下载安装包

以下为已整理软件List:

1、 MEGA 7.0.26

MEGA是一款功能强大的进化树软件,用于分析来自物种和种群的DNA和蛋白质序列数据。功能齐全,界面简单直观,非常适合生物学家和科研人员轻松进行进化分析和分子鉴定。

MEGA 7.0.26带来了更多的功能和改善,增加了了向导式系统,用于识别树中的基因复制事件;并且重新考虑树资源管理器,以便可以显示多达100k类群的树;7.0重新考虑了Timetree系统,用于估计系统发育中所有分支点的相对和绝对发散时间,以便使用更直观的向导式界面,打开软件界面就可以直接选择所需功能。

有一个新功能小编必须要给程序员点个赞,Caption Expert系统终于更新了,以后就可以将标题停靠在Tree Explorer窗口中。

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2、 Primer Premier 5

Primer Premier是一款专业的引物设计软件,具有PCR或测序引物以及杂交探针设计功能,它的算法可以给定条件,搜索到最合适的引物,并筛检二级结构、二聚体、发夹结构等,以排序方式呈现在报告中。

主要界面包括了序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和 Motif 分析窗口。

这是一款很老的软件了,堪称最强大的引物搜索工具,界面简洁明了,是很多的分子生物学实验室的标配,通常我用来设计引物、看酶切位点、得到互补/反向/反向互补的序列。

目前的引物设计软件都是基于 Primer 系列,我认为在所有版本里,最好的是 Primer 5,因为小编平时用的大多是比较常规的模板,比如常规 PCR 引物设计,Primer 6 太过智能了,不适用于常规模板。

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SPSS是一款全球领先的统计分析与数据挖掘软件,可以解决从策划、数据收集到分析、报告和部署的整个分析过程,有十几个完全集成的模块可供选择,几分钟之内你就可以找到你需要的集成模块。

其实SPSS是一个傻瓜操作软件,只要认识了软件基本界面和功能,然后把你的数据准备好,输进去,点击需要进行分析的功能,软件会自动给你算出分析结果,并不需要写代码或者程序。小编最开始用的还是13的版本,现在都出到25了,软件版本也暴露年龄呀,有空我开个专题大家一起讨论用过最老的软件是什么?

回归正题,SPSS 25新增了新图表模板,可实现word等微软家族中编辑。这个新功能,通俗的说,就是SPSS输出的图表,你可以不用在原始的输出界面进行编辑修改,可以直接保存到word等里面,在进行修改。想想都很高大上!

SPSS 25还增强了最受欢迎的高级统计功能,混合线性模型(混合)和广义线性混合模型(genlin混合)、一般的线性模型(GLM)和UNIANOVA等方面都有增强。

建造现代化、吸引人的、详细的图表从来都不容易,让我们为SPSS疯狂打call!

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4、Image Lab 3

Image Lab是一款十分专业且优秀的凝胶成像分析软件,主要用于生命科学和生化实验室,通过紫外线对目标进行图像的采集,然后将信息传输到电脑中,方便研究人员进行各项数据的分析以及计算。

相比其他凝胶成像分析软件,Image Lab具有速度快、高度智能化的特点。Image Lab 3做了以下改进:可以自动作业,只需单击鼠标即可开始执行预设的和用户自编的程序,完成从图像采集到分析再到打印输出的整个实验流程;自动进行所有图像分析,或者为了进行更准确的条带检测以及控制背景水平、选择泳道等进行人为干预。

最重要的是:参数调整后报告中的数据将随时都可以进行人工调整,随时可以调整!随时!欢呼吧,改数据再也不用重新开始了!

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5、 EndNote X9

EndNote是一个专门用于管理参考文献数据库的软件,有了它,再也不用手动给参考文献编号。通过插件可以很方便地在 word 中插入文献,软件自动根据文献的先后顺序编号,并根据指定的格式将文献附在文章的最后。如果在文章中间插入了引用的新文献,软件会自动更新编号,并将引用的文献插入到文章最后参考文献中合适的位置。

文献共享之后,是不是又担心小伙伴不小心更改了你的文献记录?使用EndNote X9就完全不用担心。通过共享权限管理可将小伙伴的权限设置为“只读”或“读写”,打消你的一切顾虑!

而且用过EndNote X8的同学都知道,共享文献只能通过共享整个个人图书馆来实现。这样做既浪费科研伙伴的时间去查找所需文献,又因为共享了全部文献而无法保证科研人员其他研究的私密性。EndNote X9更新添加了分组共享的功能,只需将指定文件拖入分组中即可实现精准分享,再也不用在查找文献上面浪费时间了!

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DNAMAN:生信数据的挖掘机,一款高度集成化的分子生物学应用软件。主要功能包括多重序列对比、PCR引物设计、蛋白质分析、质粒绘图等功能,广泛应用在各大研究实验方面。

DNAMAN几乎可完成所有日常核酸和蛋白质序列分析工作,包括多重序列比对、PCR引物设计、限制性酶切分析、蛋白质分析、质粒绘图等。

DNAMAN 9新增了编辑记录信息、数据库管理、DNA和蛋白质数据库编辑等功能,可以为不同的记录使用相同的名称,还可以选择对结果的最终输出使用快速对齐或最佳对齐方式,大大的降低了操作的复杂程度!

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7、 SnapGene 5.05

SnapGene是一款非常好用的日常分子生物学软件,可以提供最快和最简单的方式来计划、可视化和文档化的分子生物学方法,还可以进行多序列比对、自动引物设计、支持 Gibson Assembly、直接导入 Genbank 序列号等。

Snapgene 功能十分强大且实用,你可在SnapGene中完成所有克隆,并且优化改善你的策略,快速创建质粒图谱,并提供优雅,信息丰富的窗口,用于模拟各种常见的克隆和PCR方法

Snapgene 既可以模拟的标准限制性克隆,也可以模拟融合克隆。比如可以用来模拟建立克隆,这使得我们设计建立克隆方案更加简便,如果克隆过程设计方案有缺陷,我们可以借助模拟发现并做出纠正。

SnapGene单一授权 $350/年,或 $750/永久,小编提供的免费破解版不香吗!!!

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8、 OriginPro 8.5.0

推荐一款操作简单的函数绘图工具,可用于函数的数据分析和绘图;

这是同事推荐给小学妹的软件,美名其曰在保证功能的同时比同类型软件的操作都要简单,小编在表示不屑一顾之后,真香!Origin8.5操作简单,满足新手基本制图需要的同时,也适用于小编这种高级用户数据分析、函数拟合的需要;

Origin8.5的绘图是基于模板而运行的,其系统本身就为用户提供了几十种二位和三维的绘图模板,同时允许用户自行定制模板,用户可根据自己的喜好进行函数的设置。不仅可以自定义模板之外,还可自定义数学函数、图形样式和绘图模板;

最方便的是,Origin8.5与其他程序相比最大的不同在于它可以和各种数据库软件、办公软件、图像处理软件等方便地连接,省时!省事!

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9、 SigmaPlot14

一个完全专业的图形和数据分析程序,它比Excel程序功能更强大,工具更多,推荐给需要专业数据分析图表的战友;

下载前小编面对官网800多页的使用手册望而却步,但实际操作下来非常简单,新手小伙伴建议咨询高级玩家,不要独自“打野”:打开软件即可快速创建详细图表,只需点击创建图表选项卡,选择图形类型,使用图形向导选择你的数据,就可以在几秒钟内创建一个图形。还可以创建一个格式化的工作表,或使用模板或图形样式库一次又一次应用喜欢的图形样式;

同时支持直接在Word或PowerPoint中编辑图形,或者在SigmaPlot内用Excel电子表格绘制数据;允许用户自行建立任何所需的图型,自定义所有图表和地图,并具有多种2D和3D效果;

隐藏技巧:只要用SigmaPlot将图制作完成即可动态连结给其它软件展示使用,并可输出成EPS、TIFF、JPEG等图形格式,即使在网页上也可以发布高质量的地图和图表。

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10、Jade 6.5

MDI Jade是处理粉末XRD数据的重要软件,也是搜索标准衍射数据的有力工具,因此,它是化学、材料研究人员的必备软件之一。

我当前使用的软件版本为MDI Jade 6.5,这是小编使用下来最好用的一个版本,软件打开界面的菜单栏已经囊括了常用的功能,如平滑,寻峰,检索等。

MDI Jade可以对X射线衍射进行分析,通过分析结果,可以直观的判断分辨出材料的构造,知道材料的成分、内部原子、分子的结构形态等等,对于刚走上科研的用户来说,是非常不错的选择。

很多读者都在问Coffeekup和Jade哪个更好用,小编平时用Jade更多,同事也都认为Jade更纯粹一些,因为它设计为专门用于view的template语言,因此语法设计上、特性裁剪上更好一点。

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11、 Gaussian 09W

一个功能强大的量子化学综合软件包,可预测周期体系的能量、结构和分子轨道,我一般把它作为计算工具,用于取代基的影响,化学反应机理,势能曲面和激发能等化学课题的研究;

建议与Gaussview连用,有网友反馈Gaussview比较鸡肋,但这年头搞什么不得会点计算,原理不用全会,会用就成;

小编接触Gaussian软件大约三年,关于使用手册有以下建议,Gaussian官方推荐的教材是Explore the world with electronic methods,目前出到第三版。但扫描版本只有第二版,使用的软件是Gaussian94,我倾向于改改个别关键词用于Gaussian09的学习;

熟悉Gaussian的用户都清楚仅仅靠算例是不够的,应该多去读文献,个人推荐jacs,angew,jpcc一类的杂志,重复他们的结果,不久之后计算水平大大的提高。

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12、 ChemOffice suit 2018

Chemoffice可以说是化学结构绘制工具中的王牌软件,功能强大,涉及面广。看软件的大小就知道比化学金排大很多倍;

软件开始界面给出了直观的图形界面,开创了大量的变化功能,只要稍加实践,便会很容易地绘制出高质量的化学结构图形;

我用chemdraw最多,主要用来画分子结构式用的,画完结构式Analysis立马各种信息都出来了哈哈,还可以进行NMR预测,各种强大,搞科研必备;

Chemdraw是Chemoffice套件里面唯一支持Mac版的。

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13、 Mestrenova14

一款好用的核磁共振数据处理软件,可预测化合物氢谱、碳谱,HSQC,杂核谱,其中Mestrenova预测更为准确,可模拟峰形,准确度高于同类型软件;

在此给mestrenova直观可视化的操作界面点个赞,回想小编对着电脑挠头寻找某功能的经历,简单可操作才是王道(PS:划重点!科研人员发量还是很优秀的);

新版本的Mestrenova14采用了全新的ui界面,增加了多个实用新功能,包括NMR,MS,NMRPredict,屏幕,数据库,结构解析等;增加了自定义NMR数据导入功能,改进了堆积图,增加了用于2D NMR光谱分辨率的新算法;同时改进了Mnova屏幕,现在对布鲁克的FBS提供了高级支持,同事更新后发现导入/导出结果时间缩短了一半,小编终于不用再苦等了!

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14、 HyperChem 8.1

一款以高质量,灵活易操作而闻名的分子模拟软件。利用 3D 对量子化学计算,对分子力学及动力学进行模拟动画,主要是用于教学,极少用于科研;

HyperChem的优点是可以提供比其它 Windows 软件更多的模拟工具、图形界面,可进行量子化学计算(分子力学及分子动力学模拟);可使用量子化学半经验(AM1、PM3);

小编翻了一下帖子,好像没人提到Hyperchem,与上面推荐的Chemdraw相似,个人认为大多功能相似,但各有亮点。计算功能上HyperChem好得多,特别适用于不做专业计算的有机化学研究者,当然科研方面的专业计算除外;

存在的问题是所有功能较简单,复杂模拟结果可信性低。推荐给新手作为入门程序,灵活易操作,上手快,功能也比较多,QM,MD,MM都能做;

此外,这个程序是商业软件,发表文章的小伙伴注意处理好版权问题。

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15、GaussView 6

搞科研的同学都知道,制图软件一般对设备的要求非常高, GaussView软件作为化学软件中的一股清流,既可以画结构还能做各种数据计划,但本身对电脑要求很低,软件本身也是免费的!免费的东西不香吗!!

软件的制图能力也是很抗打的,论分子的三维模型制图没有比GaussView 6更强大的软件,熟练了以后画一个C60都是很容易的事。另外,有时也会用ChemDraw画出二维结构,再导出到GaussView的输入文件格式也是很方便的。

喜欢玩游戏的科研党的福利来了,在GaussView你可以用球键模型创造各种化合物并验证是否可能存在,有时候计算复杂的化合物都可以算个好几天呢,一边玩游戏,一边学习化学,导师都没有理由反驳你!

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16、 AutoCAD 2019

AutoCAD一般用于二维绘图、详细绘制、设计文档和基本三维设计,现已经成为国际上广为流行的绘图工具。

AutoCAD最大的优点就是功能齐全,可用范围广,它具有良好的用户界面,通过交互菜单或命令行方式便可以进行各种操作,同时它的多文档设计环境,让非计算机专业人员也能很快地学会使用。

让分子生物学研究变得简单易行的软件

从当初的08换成了现在的19,小编不由感慨:CAD,有你真的挺好!小编推荐新手下载2019的版本,2019版的相对之前的版本优化了很多细节,使操作更加的流畅,而且在之前的基础上增加了一些适合新手用户的文档设计环境,更容易上手。

小编不推荐下载迷你CAD,迷你CAD虽然不吃配置,但它阉割了很多功能,普通看图用用还行,实际涉及到工业层面和设计上是完全比不上AutoCAD的。

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17、 3Dmax 2018

3DMAX是一款强大的三维设计软件,产品设计、影视动画、虚拟现实这三类它都可以很好的适用进去,而且还有很多插件和模型库可以使用。

3Dmax自学是有一定的难度,但并不是不可以达成。学3Dmax的话,那就从建模开始,3Dmax可分为建模、材质、渲染、灯光(学习的过程可按照顺序来),这几个都是基本,每个都包含着大量的操作。建议如果自学需要有简单建模软件的基础,才能更快的对3Dmax上手。

小编建议把3DMAX和Lumion配合使用,Lumion属于渲染器 是将模型与材质进行渲染,3DMAX虽然能渲染但是主要功能则是建模,产品设计先用3DMAX建模然后交给Lumion渲染

PS:3DMAX做室外模型也很厉害的,而不是“室内专业户”!

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18、 Multisim 14

Multisim是一款功能强大的电路仿真软件,在用multisim仿真的时候,在电路中加入的器件一定范围内都是可以用数学来建模器件特性的。

如果小白想从0开始学习Multisim,推荐用protues,因为这个软件可以仿真单片机,很适合电子专业大一大二大三的同学。

有读者问Multisim仿真时电脑黑屏是什么原因,小编在此说明一下,不是软件的问题!因为仿真的时候对CPU和显卡运算要求是很高的,出现黑屏或者卡屏大概率是你的电脑比较老了,无论是显卡还是CPU的发热比较大,散热又比较差。

提供几个解决黑屏、卡屏的方法:1. 清理一下电脑的风扇。改善散热。2. 重装一下显卡的驱动,很大可能是显卡原因。3. 重装下multisim软件。

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19、 Lumion 5

Lumion是一个实时的3D可视化工具,涉及到的领域包括建筑、规划和设计。它的强大就在于能够提供优秀的图像,表现是这软件的强项,上手版容易,1天就OK;模型不用渲染,软件是实时渲染的,为你节省时间、精力和金钱。

小编刚接触lumion的时候那个时候还是lumion2.0,当时看到后就惊呆了,原来还有这么有意思的制图软件,一下子迷恋上了,当时拿着三千多块配置的电脑就是一顿乱撸。从此一发不可收拾……

如今lumion已经不只是那个单纯做效果图和简易动画的软件了,它的功能足以强大到你窒息……每一次升级都是一次质的飞跃,每一次的更新都会让操作更加得心应手(但是对电脑的要求也越来越高)!

小编推荐下载Lumion 5,该版本对CPU的要求不高,而且简单易懂,操作便利,出图效果快。

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UG是为用户的产品设计及加工过程提供数字化造型和验证手段的三维软件。该软件拥有强大的功能性版块,既可以进行造型和三维设计,又可以进行编程以及后期的模具设计。

小编对UG感触比较深的是软件命令比较强大,自由度高,对于有些特征你不想让它发生关系,软件就会默认特征间没有关系,而且UG中将很多规格化的特征划分的非常细致,如Pocket、Slot等,建模效率非常高,还有一点就是UG转换机器码的效果很好。

注意:UG从10.0才开始支持中文文件名,而且有些老的CPU平台上都装不了高版本的UG了,9.0开始没有32位的安装包了,也不支持XP系统了!

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21、 Matlab 2018a

Matlab2018a是一款十分专业的实用型商业数学工具,软件操作便捷,是根据用户的思维方式和工作内容打造的软件,目前已有数百万工程师和科学家使用该软件来解决复杂的设计难题。

Matlab的长处是矩阵运算,对于信号处理、图像处理、数学建模、数据分析等方面非常擅长,它的中文版功能全面,能够支持用户快速分析数据、开发算法或者创建模型。

小编发现Matlab软件的规律是越新的版本,支持的库越多,2018a就继承了深度神经网络部分,可以调用GPU训练网络,或者直接用现成的网络,这个对于不想学python的人来说,是福音啊!

此外,2015之前的版本,矩阵和数组的操作不够灵活,比如一个列向量+行向量,这个操作就不能实现,而2018a,会自动计算成一个矩阵。

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22、 Honeyview V5.32

小编用过的看图软件不少,轻量级的Honeyview是一款非常不错的软件,比系统自带的强,比强大到翻天的ACDSEE等老牌要快,毕竟大部分人能用到的功能就那几样。

首先界面干净、整洁,无广告,这一点相对于市场上同类软件就很难得,如果你愿意,甚至可以隐藏全部边栏,给你一个全面屏的看图效果。

支持几乎所有图片格式的浏览,GIF动图,甚至RAW文件、PSD文件(Photoshop专用格式),功能强大到秒开图片,同时支持不解压浏览ZIP、RAR和7z压缩包中的图片,还免费!

经某资深漫画党同事发掘,Honeyview 特有的智能对开看图功能,开启模式后,秒变看漫画利器。

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23、 WinRAR 5.90

用过最好的解压软件,没有之一,之前在使用360解压软件的时候,文件解压容易出现错误,且不支持Unicode,更换为WinRAR就没有问题;

该软件为国际通用版,不会出现格式不兼容;体积小巧,不附带插件(比如:看图软件)。不过这一点有利有弊,有些人还是很喜欢附带的看图、批量命名等插件的,但小编不喜欢(豪横)!

下载方式:

可关注【科邦实验室】回复软件名获取免费下载链接。

小编后续将持续更新办公软件、化学、生物、先进制造类优质软件。

dnaman怎样安装

DNAMAN软件的安装步骤包括下载软件、解压文件、运行安装程序、遵循安装向导完成安装以及激活软件。

1. 下载DNAMAN软件:首先,您需要从官方网站或合法的软件分发平台下载DNAMAN软件的安装包。

确保下载的是与您的操作系统兼容的版本。

2. 解压下载的文件:下载完成后,找到下载的文件,通常是一个压缩包(如或格式)。

使用解压软件(如WinRAR或7-Zip)将其解压到您的计算机上的一个文件夹中。

3. 运行安装程序:在解压后的文件夹中,找到安装程序(通常是文件)。

双击该文件以运行安装程序。

4. 遵循安装向导:安装程序启动后,会出现一个安装向导。

按照向导的指示进行操作,选择安装位置、接受许可协议等。

根据您的需求选择是否创建桌面快捷方式或添加到开始菜单。

5. 完成安装:在安装向导的最后一步,点击“完成”或“安装”按钮以完成DNAMAN软件的安装。

此时,软件应该已经成功安装到您的计算机上。

6. 激活软件(如果适用):某些版本的DNAMAN可能需要激活才能使用全部功能。

如果您购买了许可证或有激活码,请在软件界面中找到“激活”或“注册”选项,并按照提示输入您的激活信息。

请注意,具体的安装步骤可能会因软件版本和操作系统而略有不同。

如果您在安装过程中遇到任何问题,建议查阅DNAMAN的官方文档或联系技术支持以获取帮助。

dnaman为什么比对失败

数据库中没有匹配数列。

在dnaman数据库比对过程中,数据库中没有匹配数列会因为没有适配选项导致比对失败。

DNAman,是美国LynnonBiosoft公司开发的高度集成化的分子生物学应用软件。

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